Pelin sadrži niz ljekovitih tvari, a ponajprije eterično ulje, sastavljeno od niza kompliciranih organskih spojeva. Osim toga, sadrži gorki glikozid absitin i gorke tvari artemisin, absintiin i anabsintiin, a od organskih kiselina u pelinu su jabučna, taninska i jantarna kiselina. Utvrđene su i tvari poput parafina, čiji sastav nije još točno određen. U listovima se nalazi zelenoplavo eterično ulje tujon, nadalje terpeni, među njima azulen, tanaceton i konačno soli kalija i mangana.

Pelin se u narodnoj medicini koristi za želučanne, jetrene i žučne tegobe.

Pelinov čaj uzima se na žlice, više puta na dan.